代入A项，水路运输和公路运输是并列关系，四羊方尊属于商朝文物，前后关系不一致。

代入B项，内河运输属于水路运输，夏代文物和商朝文物是并列关系，前后关系不一致。代入C项，货运船舶是水路运输的工具，在遗址挖掘中可能会出土商朝文物，前后关系不一致。代入D项，水路运输和长途运输是交叉关系，青铜器物和商朝文物是交叉关系，前后关系一致。

故本题选D。