商贸企业进口化妆品缴纳的消费税计入进口化妆品的成本，选项A错误；工业企业销售不动产缴纳的营业税记入“固定资产清理”科目，选项B错误；小规模纳税人购进商品支付的增值税记入相关商品成本，选项C错误；一般纳税人销售应税矿产品缴纳的资源税应记入“营业税金及附加”科目，选项D正确。