【正确答案】 C

【答案解析】合同双方约定由承包人提交履约保函的，履约保函的提交是发包人支付各项款项的前提条件。故选项A错误。发包人按合同价格的一定比例支付预付款金额，具体金额由双方在合同专用条款中约定。合同约定了预付款保函的，在合同生效后，发包人收到承包人提交的预付款保函后10日内向承包人支付预付款金额；未约定预付款保函的，发包人在合同生效后10日内向承包人支付预付款金额。故选项B错误。预付款的抵扣方式、抵扣比例和抵扣时间安排，由合同双方在专用条款中约定。故选项D错误。