（2）①纳税人善意取得虚开的增值税专用发票，如能重新取得合法、有效的增值税专用发票,准许其抵扣进项税款；如不能重新取得合法、有效的增值税专用发票，不准其抵扣进项税款或追缴其已抵扣的进项税款。②税务机关依法追缴善意取得虚开增值税专用发票已抵扣税款符合规定；但纳税人善意取得虚开的增值税专用发票被依法追缴已抵扣税款的，不属于《税收征收管理法》第三十二条“纳税人未按照规定期限缴纳税款”的情形，不适用“税务机关除责令限期缴纳外，从滞纳税款之日起，按日加收滞纳税款万分之五的滞纳金”的规定，即税务机关不可以对上述已抵扣税款加收滞纳金。③纳税人不可以直接向人民法院提起行政诉讼。理由：申请人对税务机关作出的征税行为不服的，应当先向行政复议机关申请行政复议；对行政复议决定不服的，可以向人民法院提起行政诉讼。（3）可以申请代开增值税专用发票。货物运输业小规模纳税人在境内提供公路或内河货物运输服务，需要开具增值税专用发票的，可在税务登记地、货物起运地、货物到达地或运输业务承揽地(含互联网物流平台所在地)中任何一地，就近向税务机关申请代开增值税专用发票。