【正确答案】本案涉及定金罚则的适用问题。
定金是合同担保方式的一种。《担保法》第89条规定，当事人可以约定一方向对方给付定金作为债权的担保。债务人履行债务后，定金应当抵作价款或收回。给付定金的一方不履行约定的债务的，无权要求返还定金；收受定金的一方不履行约定的债务的，应当双倍返还定金。
关于定金的数额，《担保法》第91条规定，定金数额由当事人约定，但不得超过主合同标的额的20%。《担保法解释》第121条进一步规定，当事人约定的定金数额超过主合同标的额20%的，超过的部分，人民法院不予支持。本案中，双方约定的定金数额已经超过主合同标的额20%，法院可以支持的定金数额为主合同标的金额的20%，即40万元。
《担保法解释》第120条第2款规定，当事人一方不完全履行合同的，应当按照未履行部分所占合同约定内容的比例，适用定金罚则。本案中，甲公司为部分履行，其履行的部分占合同约定内容的一半，因此定金罚则适用的结果应当是：甲应向乙返还一半定金的双倍。
基于以上分析，本案处理结果应当是：甲向乙返还定金40万元。