索赔费用的计算方法有：实际费用法，是计算工程索赔时最常用的一种方法；总费用法，是当发生多次索赔事件以后，重新计算该工程的实际总费用，实际总费用减去投标报价时的估算总费用，即为索赔金额；修正的总费用法，是对总费用法的改进方法。