【答案解析】反腐败工作在进行当中遇到的主要问题有：检查部门独立职能不强，往往受制于行政部门的行政命令或决策影响，不能摆正自己的位置；地方政府依法行政和民主的程度不够，很多时候人治大于法制，专制代替群治；执法人员往往受到人情关系、请托之风的影响，不能做出正确的判断；腐败问题和地方经济利益相勾连，一些地方政府为了局部经济利益，拖延甚至无视腐败问题的严重性。