政府质量监督部门对施工中发生的质量问题、质量事故进行查处；根据质量检查状况，对查实的问题签发“质量问题整改通知单”或“局部暂停施工指令单”，对问题严重的单位也可根据问题的情况发出“临时收缴资质证书通知书”等处理意见。因此，正确答案为C。