本题考查公安机关的职权。

《公安机关办理刑事案件程序规定》对公安机关的管辖权进行了界定，第十四条规定：“根据刑事诉讼法的规定，刑事案件由公安机关管辖，但下列刑事案件除外：（一）贪污贿赂犯罪，国家工作人员的渎职犯罪，国家机关工作人员利用职权实施的非法拘禁、刑讯逼供、报复陷害、非法搜查的侵犯公民人身权利的犯罪以及侵犯公民民主权利的犯罪案件，经省级以上人民检察院决定立案侦查的国家机关工作人员利用职权实施的其他重大的犯罪案件；（二）自诉案件，但对人民法院直接受理的被害人有证据证明的轻微刑事案件，因证据不足驳回起诉，人民法院移送公安机关或者被害人向公安机关控告的，公安机关应当受理；被害人直接向公安机关控告的，公安机关应当受理；（三）军人违反职责的犯罪和军队内部发生的刑事案件；（四）罪犯在监狱内犯罪的刑事案件；（五）其他依照法律和规定应当由其他机关管辖的刑事案件。”

A项错误，按照上述第二款规定，公司之间的债权纠纷属于民事主体之间的民事纠纷，应到人民法院自诉。

B项错误，按照上述第三款规定，军人李某的案件应交由军队处理。

C错误，《刑事诉讼法》第二百六十四条规定：“对被判处死刑缓期二年执行、无期徒刑、有期徒刑的罪犯，由公安机关依法将该罪犯送交监狱执行刑罚。对被判处有期徒刑的罪犯，在被交付执行刑罚前，剩余刑期在三个月以下的，由看守所代为执行。对被判处拘役的罪犯，由公安机关执行。”题干中吴某被处3年有期徒刑，应交由监狱执行。

D项正确，《刑法》第二百九十一条规定：“投放虚假的爆炸性、毒害性、放射性、传染病病原体等物质，或者编造爆炸威胁、生化威胁、放射威胁等恐怖信息，或者明知是编造的恐怖信息而故意传播，严重扰乱社会秩序的，处五年以下有期徒刑、拘役或者管制；造成严重后果的，处五年以上有期徒刑。”顾某的行为触犯刑法，应由公安机关处理。

故正确答案为D。