【正确答案】 C

【答案解析】解析：司法解释规定：涉嫌犯罪的单位被撤销、注销、吊销营业执照或者宣告破产的，对实施犯罪行为的该单位直接负责的主管人员和其他直接责任人员追究刑事责任，对该单位不再追诉。本题中，因为单位已经破产，不能再对该单位进行追诉，但是甲公司已经犯罪，应当按照单位犯罪追究该单位直接负责的主管人员和其他直接责任人员的刑事责任，而不是按照自然人犯罪追究直接责任人员的刑事责任。因此正确答案为C。