[解析] A选项，最终结清申请单应由承包人在缺陷责任期终止后向发包人提交；B选项，承包人按合同约定接受了竣工结算支付证书后，应被认为已无权再提出在合同工程接收证书颁发前所发生的任何索赔；C选项，承包人在提交的最终结清申请单中，只限于提出工程接收证书颁发后发生的索赔。