8.  在实验中经常会筛选到一些新的蛋白质突变体,这些突变体蛋白的一级结构通常与野生型差别很小,甚至只有个别氨基酸残基的突变,但是在活性上却有较大的改变。为了解释蛋白质一级结构的突变对其活性的影响,首先需要了解突变体空间结构的改变。但是利用晶体衍射或核磁共振技术解析蛋白质的空间结构有很多条件的限制,通常可以通过生物信息学同源建模的方式获取突变体的空间结构,请简述同源建模的一般步骤。
【正确答案】同源建模又称为比较建模,其原理是序列相似则结构相似,即存在同源关系的两条序列具有相似的结构。同源建模是指寻找与目标序列同源而且有实验测定结构的蛋白质作为模板,从而构建目标序列结构的方法。其一般步
   骤为:
   ①搜索同源蛋白质结构,序列相似性一般>30%;
   ②得到目标序列和模板序列最可能的完整比对;
   ③以模板结构骨架作为模型,建立目标蛋白质骨架模型;
   ④在空位区域,使用环建模过程代替合适长度的片段;
   ⑤给骨架模型加上侧链;
   ⑥优化侧链的位置;
   ⑦使用能量最小和其他优化方法优化结构。
【答案解析】