《环境保护法》第二十六条第二款规定：“防治污染的设施不得擅自拆除或者闲置，确有必要拆除或者闲置的，必须征得所在地的环境保护行政主管部门同意。”该化工厂位于密云县，密云县环保局为其所在地的环境保护行政主管部门。故应选D。