[解析] 加入菌剂增加了土壤中生物的种类和数量，可以提高土壤生态系统的稳定性，A项正确。该菌剂减少了残留农药进入农作物，有利于其他生物的生存，促进土壤中的物质循环，B项错误。土壤有毒物质的减少有利于增加农田动物的种类，降低害虫的优势度，C项正确。农药降解菌具有分解农药的特殊代谢途径，体现了基因多样性的应用价值，D项正确。