治疗伤寒邪在少阳，寒热往来，常与黄芩同用的药物是
薄荷
牛蒡子
菊花
葛根
柴胡
解析：柴胡长于疏散少阳半表半里之邪，为少阳证之要药，常配黄芩，以清半表半里之热，共收和解少阳之功，如《伤寒论》中的小柴胡汤。故答案应选择E。