【正确答案】 C

【答案解析】[考点] 建设工程施工合同 [解析] 根据最高人民法院《关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释》第1条第1款第(1)项，承包人未取得建筑施工企业资质或者超越资质等级的，应根据《合同法》第52条第5项的规定，认定无效。甲公司与没有建筑施工资质的某施工队签订合作施工协议，该合作施工协议无效，A错误。甲公司与乙公司签订建筑施工合同无法律规定的无效事由，有效，B错误。根据上述司法解释第2条，虽然甲公司与施工队的合作施工协议无效，但因办公楼竣工验收合格，施工队有权参照合同约定向甲公司主张工程款，C正确。虽然乙公司尚有部分剩余工程款未支付给甲公司，但该债权债务关系属于甲乙公司之间，甲公司不得据此拒绝支付施工队的剩余工程款，D错误。