ATP合酶分为基部和头部，基部是质子通道，寡霉素具有抑制质子从线粒体内膜外侧通过基部质子通道回流进入线粒体基质的用。缬氨霉素是离子载体抑制剂，能够携带钾离子进入线粒体基质，从而破坏线粒体内膜内、外两侧的电位梯度。其他两种是电子传递链的抑制剂。