问答题 你想把一段cDNA克隆到一表达载体上,这样便能在E.coli中大量生产该蛋白。cDNA是BamHI切下的片段,准备将其插入到载体的BamHI位点上,这次是你首次做克隆,因而严格遵照指南上的步骤。
   首先你得切载体DNA,且用碱性磷酸酶去除5'-磷。第二步,把处理过的载体与BamHI切出的cDNA片段混合加入连接酶后温育,连接后将它与感受态细胞混合。最后,将混合物涂布在含抗生素的固体培养基上,杀死所有未转入载体的细胞,而转入了载体的细胞由于其抗生素抗性而存活下来。
   克隆手册上提到了四种对照:①未和连接混合物混合的细菌涂平板;②转入未切过的载体的细胞涂平板;③酶切过但未用碱性磷酸酶去除5'-磷的载体,未加外源cDNA片段但加连接酶温育的混合物与感受态细胞混合涂平板;④载体酶切过,碱性磷酸酶处理过,无cDNA片段加连接酶温育后和感受态细胞混合涂平板。
   第一次做该实验的实验组和四个对照组借用同宗的感受态细胞,但所有平板上菌落太多而无法数清(见表16-3-40)。第二次做时,采用自己准备的细胞,但没有一个平板上有菌落长出。你又做了一次,这次的结果见表16-3-40。你从样品中挑了几个菌落,提取质粒DNA后用BamHI处理,有九个菌落生成和线状载体相同大小的一条带,但另三个菌落含有你需要克隆的cDNA片段。
   
表16-3-40 Results of Your cDNA Cloning Endeavor
  样品制备 实验结果
1 2 3
对照1
对照2
对照3
对照4
实验样品
只有细胞
未切的载体
无磷酸化酶、无cDNA
无cDNA
TMTC
TMTC
TMTC
TMTC
TMTC
0
0
0
0
0
0
>1000
435
25
34
TMTC=too many to count      
【正确答案】如果细胞单独克隆,有些东西是错误的,有几种可能性,它可能是你的学生用一种早已携带有抗抗生素的载体的细菌错误地制备了感受态细胞。换言之,感受态细胞污染了抗抗生素的细胞。另一种可能是忘记了在培养基中加抗生素或加的量不足。因此对照1的生长情况是确定感受态细胞培养平板是否有效的标准。
【答案解析】
【正确答案】如用没有被切的载体去转染细胞时没长菌落,肯定哪些地方出了错。有几种可能的原因,如细胞没被制备成合适的感受态而不能摄入DNA;平板中的抗生素太多;或者平板制备不正确而不能供细菌生长。因此,对照2与对照1类似,用以确定细胞和平板是否有用。
【答案解析】
【正确答案】对照3是检查切出的末端与预计的是否相同并且连接酶是否有活性,偶尔限制酶制备物或用的缓冲液污染了核酸外切酶而可修饰末端,使连接酶不能连接它们。相反,如果缓冲液组成不合适也会阻止连接酶的连接作用。
【答案解析】
【正确答案】用碱性磷酸酶除去载体5'-末端的磷以防止载体自身连接。自身连接会产生只含载体而不含插入外源基因的高背景克隆。因为cDNA没有用磷酸酶处理,它有5'-磷,因此cDNA仍能被连接到载体上。所以克隆手册上强调用磷酸酶处理载体来降低只含载体的菌落数目,进而提高重组克隆菌落的比例。
【答案解析】