学校违反国家规定收取费用的，由县级人民政府教育行政部门______所收费用。
【正确答案】 A
【答案解析】

《中华人民共和国义务教育法》第五十六条规定，学校违反国家规定收取费用的，由县级人民政府教育行政部门责令退还所收费用；对直接负责的主管人员和其他直接责任人员依法给予处分。故本题选A。