评价机构每年须填写“建设项目环境影响评价机构年度业绩报告表”，于次年3月底前报环境保护部，同时抄报所在地省级环境保护行政主管部门。针对部分环境影响评价机构工作质量不高，内部管理松散，出借资质等问题，环境保护部于2008年7月24日印发的《关于加强环境影响评价机构及从业人员管理的通知》(环发〔2008〕69号)中对评价机构质量控制、合同签订及档案管理提出了更明确要求。