本题考查人文科技。

A项错误，嬴政是始皇帝，“本纪”记载历代帝王的兴衰成败和重大历史事件。故归“本纪”。

B项正确，秦始皇统一天下之后，废分封而行郡县。李斯虽贵为丞相，却无寸土之封，且秦朝又短命，李斯亦被夷三族。而“世家”原本就有世代尊荣之意，可李斯的家族既没有传袭太久的富贵，其地位与那些南面称王、割据一方的诸侯也不可同日而语。故归“列传”。

C项错误，越王勾践，夏禹后裔，越王允常之子，春秋末年越国国君。故归“世家”。

D项错误，项羽，他并未统一天下称帝，但作者高度评价了他在反秦斗争中的领导作用，说：“三年，遂将五诸侯灭秦，分裂天下而封王侯，政由羽出，号为‘霸王’，位虽不终，近古以来未尝有也。”所以将他列入“本纪”，算一个特例。

故正确答案为B。