A不正确：注册会计师仅在有迹象表明审计证据不可靠时才进行鉴定；B正确：因为注册会计师不对所有交易进行审计；C正确：例如，确定审计证据数量时可能需要确定可容忍误差；D不正确：只对询证函进行口头回复不是对注册会计师的直接书面回复，不符合函证的要求，因此，不能作为可靠的审计证据。