【正确答案】 B

【答案解析】 对于选项A，JDK中的编译器为javac.exe，可以用来把Java代码编译为中间代码.class文件。所以，选项A错误。
   对于选项B，java.exe是Java解释器，用来解释执行通过javac编译生成的.class文件。所以，选项B正确。
   对于选项C，JDK文档生成所使用的命令为javadoc.exe，而不是java.exe。所以，选项C错误。
   对于选项D，JDK也提供了很多类分析工具，例如jstack用来查看线程情况(观察JVM中当前所有线程的运行情况和线程当前状态，可以查看堆栈信息和运行的线程的方法调用关系)，jmap用来查看内存堆情况。所以，选项D错误。
   所以，本题的答案为B。