（1）核孔复合体镶嵌在内外核膜融合形成的核孔上，是由环、辐、栓等结构亚单位由外向内组成下列结构：①胞质环：位于核孔边缘的胞质面，在环上有8条纤维伸向胞质；②辐：由核孔边缘伸向核孔中央，呈辐射状排列，连接内外环；③栓：位于核孔的中心，可能起物质运输作用；④核质环：环上对称地连有8条纤维伸入核内，在纤维的末端形成核篮。
（2）核孔复合体在功能上可以被认为是一种特殊的跨膜蛋白复合物，构成了核质间双向运输的亲水通道。①介导被动运输：其有效直径为9～10nm，因此离子、小分子和10nm以下的物质原则上可以自由通过核膜；②通过核孔复合体的主动运输：生物大分子的核质分配主要是通过核孔复合体的主动运输完成的，具有高度的选择性，并且是双向的。选择性表现在以下3个方面：对运输颗粒大小的限制，有效功能直径可达26nm；主动运输是一个信号识别与载体介导的过程，需要消耗能量，并表现出饱和动力学特征；主动运输具有双向性，既可以进行核输入也可以进行核输出。