免疫共沉淀是指以抗体和抗原之间的专一性作用为基础的用于研究蛋白质相互作用的经典方法， 是确定两种蛋白质在完整细胞内生理性相互作用的有效方法。 当细胞在非变性条件下被裂解时， 完整细胞内存在的许多蛋白质-蛋白质间的相互作用被保留了下来。 当用预先固化在琼脂糖小球上的蛋白质 A 的抗体免疫沉淀 A 蛋白，那么与 A 蛋白在体内结合的蛋白质 B 也能一起沉淀下来。 再通过蛋白变性分离， 对 B 蛋白进行检测， 进而证明两者间的相互作用。