【正确答案】 C、D

【答案解析】 工程预付款是发包人预先垫支的工程款，不是承包人，选项A错误；工程是否实行预付款取决于工程性质、承包工程量的大小及发包人在招标文件中的规定，选项B错误；预付的工程款必须在合同中约定扣回方式而不是由发包人单独决定，选项E错误。答案选择C、D。