导向、政策标准和政策操作是否公开和透明；分流人员的利益是否能够得到有效保障等。这方面，我国当前做的确实不够，很多方面落实不到位，分流后工作岗位不能保证，分流人员的自身利益得不到保障，政策也不够健全，不能保证分流的顺利进行。有些机构改革实行富余人员带职分流，超编干部离开机关，保留职级。很多单位通过设置一些事业编制的机构或者行业协会等来消化这部分人员，搞体外循环。这样做，不仅增加了改革成本，而且增添了新的“准”管理机构。
（3）大部门制改革的对策
①梳理部门关系。实行“大部门制”不是简单地把职能相近、业务雷同部门合并或拆减，而要对“三权”进行厘清、分立归属，并使其相互制约，形成良好的权力制衡与监督的运行机制。它暗含了更多政府权力规制、重构的内容，决策与执行、监管适度分离。充分发挥大部门的优势，并实现决策与执行职能的分离。我们可以参照别国的做法，成立执行机构，使其与决策部门之间形成清晰的责任关系，这样，既有利于政府核心部门专心致力于决策，保证决策的高效和科学，又有利于使政策得到更好的执行，还有助于减少因权力集中而导致的腐败现象。
②创新行政文化。转变行政文化观念的主要问题，就是根据我国社会发展进步的客观诉求，不断校正和确定政府在广泛的经济生活、政治生活、社会生活、文化生活中的角色定位和角色规范问题，这种定位要跟得上时代发展的步伐。这种角色定位和角色规范更需要相关的法律法规加以明确和规范，从制度上而不是从意念和道德上去规范。从我国现实的情况来看，进一步明确区分公法与私法意义上的政府的权利与义务，从私法的意义上树立官民平等的行政观念，进而克服“政府中心论”、“官本位”以及“自为行政”的观念，这是政府行政改革的主要难点之一。
③完善人员分流制度。要在各级各地政府的统筹安排下，让分流人员在预定的时间内相对顺利的离开政府，离开原来的工作岗位，较为顺利地走上新的工作岗位。关于人员分流的政策导向、政策标准和政策操作具有公开性和透明度。要把工作需要，群众参与，综合考评，组织决定结合起来，为实现群众参与和竞争上岗而制定必要的规则、程序和形式。同时，完善人员分流制度，保障分流人员的利益，解决其后顾之忧，使人员分流实现平稳过渡，减少动荡，这样，才能减少改革的阻力。人员分流是维护国家正常秩序的保障和基础，关乎整个公务员队伍的稳定和社会的安定。
④健全法律保障制度。在进行大部门制改革后，相关的执法主体，诉讼管辖和法律适用范围等会出现诸多新的问题和矛盾。与此同时，大部门制改革必然会涉及到现行法律法规的修改修正问题，我国政府应当以此为契机，实行综合立法，使我国的法律体系进一步协调和统一。