【正确答案】 B、C、D

【答案解析】 《专利权质押登记办法》第三条规定，以专利权出质的，出质人与质权人应当订立书面质押合同。质押合同可以是单独订立的合同，也可以是主合同中的担保条款。因此，甲公司与乙银行不是必须订立单独的合同，选项A错误。专利法实施细则第十四条第三款规定，以专利权出质的，由出质人和质权人共同向国务院专利行政部门办理出质登记。因此，选项B正确。《专利权质押登记办法》第十二条第一款规定，专利权质押登记申请经审查合格的，国家知识产权局在专利登记簿上予以登记，并向当事人发送《专利权质押登记通知书》。质权自国家知识产权局登记时设立。因此，选项C正确。《专利权质押登记办法》第十五条规定，专利权质押期间，出质人未提交质权人同意其放弃该专利权的证明材料的，国家知识产权局不予办理专利权放弃手续。因此，选项D正确。