(1)会计师事务所以业务收入作为合伙人考核和晋升制度规定不符合规定。

理由：会计师事务所的领导层应当树立质量至上的意识，建立以质量为导向的业绩评价、工薪及晋升的政策和程序，而不应当以业务收入额作为标准和途径。

(2)会计师事务所内部业务检查制度不符合规定。

理由：会计师事务所应当周期性地选取已完成的业务进行检查，周期最长不得超过三年。在每个周期内，应对每个项目负责人的业务至少选取一项进行检查。在确定检查范围时，会计师事务所可以考虑外部独立检查的范围或结论，但这些检查不能替代自身的内部监控。

(3)由审计项目负责人进行项目质量控制复核不符合规定。

理由：项目质量控制复核人员应独立于项目组，应挑选不参与该业务的人员来执行。审计项目组负责人不能作为复核人员执行本项目的质量控制复核工作。

(4)工作底稿保管制度不符合规定。

理由：原纸质工作底稿不能销毁。即使原纸质记录经电子扫描后存入业务档案，事务所也应当保留已扫描的原纸质记录。

(5)审计项目组的独立性政策不符合规定。

理由：会计师事务所应当每年至少一次向所有受独立性要求约束的人员获取其遵守独立性政策和程序的书面确认函，而不仅仅限于高级经理以上人员。

(6)分所管理制度规定不符合规定。

理由：根据会计师事务所质量控制准则第五条，会计师事务所在制定质量控制政策和程序时，应当考虑自身规模和业务特征等因素。相关的质量控制制度是事务所整体(含分所)都要遵守的。ABC会计师事务所应应当将质量控制政策和程序形成书面文件，并传达给分所，分所不能自行制定业务质量控制制度。