【正确答案】 C

【答案解析】解析：《中华人民共和国动物防疫法》规定：“跨省、自治区、直辖市引进乳用动物、种用动物及其精液、胚胎、种蛋的，应当向输入地省、自治区、直辖市动物卫生监督机构申请办理审批手续，并在运输前向当地动物卫生监督机构申请检疫。"由题目得知，乙省B县为种猪的输入地，故由乙省动物卫生监督机构负责审批。