下列交易或事项中，应记入“管理费用”科目的有( )。
生产车间机器设备计提的折旧
企业合并形成的长期股权投资取得时发生的直接相关费用
研发支出的研究费用
发行股票的发行费用
解析：选项A，应计入制造费用；选项D，应冲减股票溢价发行收入(资本公积)，溢价收入不足冲减的，冲减留存收益。