【正确答案】 B

【答案解析】[解析] 法理学与部门法学之间的关系表现在：(1)法理学与法制史、法律思想史的关系是“论”和“史”的关系，故A项错误。(2)法理学与部门法学的关系是“一般”与“特殊”的关系。法理学的材料来源是通过对所有部门法材料进行高度抽象概括获得的，故B项正确。而“整体”与“部分”、“理论”与“方法”都不属于法理学和部门法学之间的关系，故排除CD项。因此本题正确答案为B项。