A项正确，传染性非典型肺炎虽然属于乙类传染病，但应用甲类传染病管理。
B项正确，肺炭疽虽然属于乙类传染病，但应用甲类传染病管理。
C项错误，艾滋病属于乙类传染病，应用乙类传染病管理。
D项正确，鼠疫属于甲类传染病，应用甲类传染病管理。
本题为选非题，故正确答案为C。