【正确答案】设计的实验方案如下： (1)选取眼睛还处在发育阶段的果蝇，设置实验组和对照组。 (2)根据目标基因已知的序列，利用基因同源重组或RNA干扰等方法敲除实验组的目标基因。 (3)实验组和对照组两组果蝇均正常饲喂，观察比较两组果蝇眼睛发育过程中的变化。 (4)结论：若实验组果蝇眼睛发育异常，则说明该基因涉及果蝇眼睛发育。