胆囊炎和胆管炎在胆汁淤积的基础上继发细菌感染。细菌可经血或淋巴管到达胆道，也可从肠道经十二指肠乳头逆行进入胆道。细菌以需氧和厌氧多菌种混合感染。绝大多数为肠源性细菌，以需氧革兰氏阴性肠杆菌阳性率最高，也有革兰氏阳性肠球菌。