【正确答案】 D

【答案解析】[考点] 动词时态
“by the time”意为“到……时为止”，引导时间状语从句。根据句中的时间状语tonight并结合句意可知，“在机场等待三个小时”是发生在将来的持续性动作，所以要用将来完成进行时，表示将来某时、某事之前已经发生的动作，一直延续到将来某一时间。故选D。
   等今晚你的飞机着陆时，我在机场就已经等三个小时了。