商业银行内部审计的主要内容包括：(1)经营管理的合规性及合规部门工作情况；(2)内部控制的健全性和有效性；(3)风险状况及风险识别、计量、监测和控制程序的适用性和有效性；(4)信息系统规划设计、开发运行和管理维护的情况；(5)会计记录和财务报告的准确性和可靠性；(6)与风险相关的资本评估系统情况；(7)机构运营绩效和管理人员履职情况等。