【正确答案】 C

【答案解析】[考点] 诉讼与仲裁
[解析] 《民诉意见》第148条规定，当事人一方向人民法院起诉时未声明有仲裁协议的，人民法院受理后，双方当事人又应诉答辩的，视为该人民法院有管辖权。
　　《仲裁法》第26条规定，当事人达成仲裁协议，一方向人民法院起诉未声明有仲裁协议，人民法院受理后，另一方在首次开庭前提交仲裁协议的，人民法院应当驳回起诉，但仲裁协议无效的除外；另一方在首次开庭前未对人民法院受理该案提出异议的，视为放弃仲裁协议，人民法院应当继续审理。
　　本题中，南京公司于庭审中才提交仲裁协议，对法院管辖权提出异议，应视为放弃仲裁协议，人民法院应当继续审理。故AD项的内容是错误的，而C项内容正确，依题干要求应予选择。至于B项的叙述，继续审理是正确的，但理由不正确，因为传真函是仲裁协议的有效形式(《合同法》第11条)。故依题干要求B项不宜选择。