（1）线粒体和叶绿体结构的相同点
① 都由双层膜包被，具有外膜、膜间隙、内膜和基质等结构。
② 外膜均具较高的通透性，而内膜通透性差，内膜上均含有大量的转运载体蛋白，内膜包含的基质中均含有执行各自功能所需要的多种酶蛋白，内外膜之间有膜间隙。
③ 含有的ATP酶的基本结构类似。
④ 基质中均含有环状DNA、RNA和核糖体，可以自主合成自身某些蛋白质。
（2）线粒体和叶绿体结构的不同点
① 外形
a. 线粒体常见外形以线状和颗粒状为主。
b. 叶绿体呈绿色凸透镜或铁饼状。
② 内膜
a. 线粒体内膜向内折叠成嵴，内膜及嵴上含有电子传递链和ATP酶。内膜的标志酶是细胞色素氧化酶。
b. 叶绿体内膜并不向内折叠，内膜不含电子传递链，衍生而成类囊体，捕光系统、电子传递链和ATP 酶都位于类囊体膜上。
③ 外膜
a. 线粒体厚约6nm，标志酶是单胺氧化酶。
b. 叶绿体外膜掉6〜8nm。
④基质
a. 线粒体基质含有与三羧酸循环相关的酶类。
b. 叶绿体基质含有参与CO₂固定反应的所有酶类，是光合作用固定CO₂的场所。叶绿体内部具有由内膜衍生而来的封闭的扁平膜囊，称为类囊体。