本题考查的是固定资产构建的账务处理。

“在建工程”科目核算企业基建、更新改造等在建工程发生的支出，借方登记企业各项在建工程的实际支出，贷方登记完工工程转出的成本，期末借方余额，反映企业尚未达到预定可使用状态的在建工程的成本。

“工程物资”科目核算企业为在建工程而准备的各种物资的实际成本，借方登记企业购入工程物资的成本，贷方登记领用工程物资的成本，期末借方余额，反映企业为在建工程准备的各种物资的成本。

本题中，某企业领用建造生产线专用材料一批，成本为400万元，计入“在建工程”科目，“在建工程”科目属于资产类科目，增加计入借方。同时，领用专用材料，计入“工程物资”科目，“工程物资”科目属于资产类科目，减少计入贷方。因此，账务处理如下：

借：在建工程 400万

贷：工程物资 400万

故正确答案为C。