水域生态系统区别于其他生态系的主要特点之一在于水这一环境因子。水的某些特性对生态系统中的其他因子具有重要影响，水生生态系统的特点如下：

（1）氧气浓度低

水的溶氧量远小于空气中氧气的浓度，水生植物和动物进化出一系列适应低氧环境的系统。如水生植物的通气组织发达。

（2）环境温度相对稳定

水的比热较大，导热性能差。水温，尤其是大洋水温，比陆地稳定得多。如温带海域全年温度变幅一般为10～15℃，两极和热带海域仅约5℃。

（3）光照比较弱

光线在水中的穿透力比在空气中小。日光射入水体后衰减较快。特别是在海洋中，只有最上层海水中才有足够的光照保证植物进行光合作用。在某一深度处，光照的强度减弱至植物光合作用生产的有机物质适不足以补偿其自身的呼吸作用的消耗。

（4）生产者较少，消费者多

水生生态系统没有陆地生态系统提供的各种生境，植物较少，以鱼类等水生消费者为主。