《大清律例》中规定的清朝基本刑罚体系，仍然是隋唐以来相传的笞、杖、徒、流、死五种刑罚。但清朝除“五刑”外，实际上存在多种刑罚方法。(1)在刑罚适用上，对累犯处刑重于明律；扩大谋反、谋大逆、谋判等重罪处刑范围；重惩强盗、窃盗；区别公罪、私罪，处刑上私罪重于公罪。(2)迁徙是徒与流中间的刑罚。清朝定例中，迁徙多适用于斗殴杀人之案。(3)清朝的充军，列“正刑”之外，成独立刑种。充军刑亦分为五等：极边、烟瘴、边远、近边、附近。与明律不同之处是充军不连带家人。(4)清朝创设了一种新的刑罚方法，即发遣，是指将犯罪人发往边疆地区给驻防官兵为奴。这种刑罚比充军更重，多适用于政治犯。(5)枭首是清朝使用较为广泛的死刑方法。清律中，凌迟刑也被当做最重的刑罚。清朝死刑还包括斩刑与绞刑。斩、绞刑又分“立决”与“监候”两种方式。(6)清朝刺字是一种常用的附加刑，初仅限于贼盗，后扩大到缘坐、出犯、逃军、逃流、发遣等。刺字分满汉文，部位各异。(7)清朝定例中，有许多条款规定了枷号的处罚，主要适用于伦理、风化案件的附加刑罚。枷号一般是在主刑执行完毕后，将人犯带枷立于衙门之外、城门口或集市之处，时间有一月或两月。