【正确答案】 D

【答案解析】 南京国民政府的司法系统包括普通司法系统和特种刑事法庭，普通司法系统最高一级的司法机构是司法院，其下设四个直属机构：司法行政部、最高法院、行政法院和官吏惩戒委员会。可见，选D项。至于B项表述的行政院是南京国民政府设立的五院之一，五院是根据“五权宪法”而设立的机构，包括立法院、司法院、行政院、考试院、监察院。