(1)实验原理
为了研究特异性mRNA在细胞中的水平情况,先对细胞中总RNA进行提取,然后通过Northern印记分析确定mRNA水平情况。
(2)实验步骤
①细胞传代、冻存及复苏
a.传代培养:将细胞在37℃水汽饱和并含有5%CO2培养箱培养,细胞每隔3~4天传代培养一次。
b.冻存:细胞培养3~4天后,3000g离心5min,弃上清液,加入适量的新鲜培养基,用滴管反复吹打,将细胞液移至冻存管中,再加入DMSO使终浓度为10%。置于-70℃过夜,次日放入液氮中保存。
c.复苏:从液氮中取出冻存细胞,置于37~42℃水浴中并剧烈震荡使细胞快速融化,将细胞悬液移入8~10ml培养基培养一天后换新鲜培养基,以后按常规进行细胞传代。
②细胞总RNA抽提
a.每106个细胞加0.2mlRNATrizol变性液,用吸管反复吹吸使溶液均匀,RNA溶解。
b.每1ml样品中加0.2ml氯仿,用力振摇15s,置冰浴15min。
c.4℃、12000g离心10min,用75%乙醇洗两次,室温自然干燥,最后溶于DEPC水中。
③制备探针
④Northern印记分析
a.每个样品取25~30μgRNA进行电泳。
b.电泳完毕,凝胶经EB染色后紫外灯下观察电泳结果。
c.将胶块倒置于水平玻板上,胶下有纸桥与20XSSC相连,胶上依次覆盖尼龙膜、Whatmann3MM滤纸、普通新华滤纸或吸水纸及500g重物。室温下转移24~48h。
d.转移完毕,检查尼龙膜及胶上EB染料分布情况,判断转移效率,用滤纸吸去多余水分,室温晾干,80℃烘烤2h。
⑤杂交、洗膜及放射自显影
⑥统计分析
以细胞种类和辐照时间为协变量,对mRNA水平情况进行协方差分析。