[解析] 本题考查抗代谢抗肿瘤药的分类。抗代谢抗肿瘤药包括：二氢叶酸还原酶抑制剂、胸腺核苷合成酶抑制剂、嘌呤核苷合成酶抑制剂、核苷酸还原酶抑制剂、DNA多聚酶抑制剂。拓扑异构酶抑制剂属于直接影响DNA结构和功能的药物。故选E。