信号序列是指引导蛋白质定向转移的线性序列，通常有 16～26 个氨基酸残基，对所引导的蛋白质没有特异性要求。信号序列在 N 末端附近除有碱性氨基酸外，还主要含疏水性氨基酸，特别是在其中部没有带电荷的氨基酸。在合成过程中前体物质多肽靠此序列与膜结合，接着形成膜结合型多核糖体， 多肽链与其合成相平行地通过膜，并在通过膜时，由在存在膜上的肽酶将信号序列切断而除掉。