日常结论题，根据题干信息逐一分析选项。

A项：题干仅说明实验组两个班级的平均成绩均提高，无法得到每位同学成绩均提高了，无法推出，排除；

B项：题干仅说明实验组和对照组平均成绩提高的分数，并未给出实验前各个班级的成绩，因此无法计算两组学生的总成绩，无法推出，排除；

C项：题干说明甲班和乙班的平均成绩提高了9分，其中，甲班平均成绩提高了13分，乙班平均成绩提高了7分，假设甲班学生人数为，乙班学生人数为，由题干可得，化简可得

第一步：找出论点和论据。

论点：该教学方法改革有助于提高学生的英语成绩。

论据：本学期，某高校外语学院在大一的班级中进行英语教学方法改革试点，其中甲班和乙班是实验组，丙班和丁班是对照组。实验组和对照组的人数相等。期末测试后发现，实验组中甲班和乙班学生的平均成绩提高了9分，其中，甲班平均成绩提高了13分，乙班平均成绩提高了7分。对照组中丙班平均成绩提高了3分，丁班平均成绩提高了1分。

第二步：逐一分析选项。

A项：该项说明对照组学生的英语基础比实验组差，即还存在其他因素影响实验结果，对照组学生英语成绩提高较少也可能是因为英语基础较差，为他因削弱，当选；

B项：该项说明实验组学生的专业课总学时比对照组少，无法确定专业课总学时是否会对英语成绩产生影响，无法削弱，排除；

C项：该项说明对照组学生的期中英语成绩与实验组相近，即两组学生在实验前英语水平相近，排除了其他因素对实验结果的干扰，为加强项，无法削弱，排除；

D项：该项说明有些实验组学生的期末英语测试成绩下降，但题干是根据平均成绩衡量教学方法改革的效果，个别学生的情况不影响整体平均成绩，无法削弱，排除。

故正确答案为A。