【答案解析】(1)妥当。
(2)不妥。理由：投标报价不得低于企业个别成本，并不是企业平均成本。
(3)妥当。
(4)不妥。理由：因国家法律、法规、规章和政策发生变化影响合同价款的风险，发承包双方应当约定综合单价调整因素、幅度及调整办法。
(5)不妥。理由：缺陷责任期最长不超过2年。

【答案解析】(1)口头告知招标人，撤回了已提交的投标文件不妥。理由：投标人撤回已提交的投标文件，应采用书面形式告知招标人。
(2)要求招标人3日内退还其投标保证金不妥。理由：招标人应当自收到投标人书面撤回通知之日起5日内退还。

【答案解析】(1)针对投标人B的报价，评标委员会应否决其投标。理由：投标人B的投标报价中，暂列金额、材料暂估价没有按照招标文件的要求填写，未在实质上响应招标文件，故应否决其投标。
(2)针对投标人E的报价，评标委员会应否决其投标。理由：投标人E的混凝土梁的报价中，单价与总价不符，以单价为准修正总价，则混凝土梁的总价=700×520=364000(元)。投标人E经修正后的报价=3542+(364000-36400)/10000=3574.76(万元)，高于招标控制价3568万元，需请投标人E书面签字确认。若不签字，则应否决其投标；若签字，则其投标报价超过了招标控制价，仍应否决其投标。

【答案解析】评标基准价=(3489+3358+3209)/3=3352(万元)。
投标人A：3489/3352×100%=104.09%，总报价得分=60-(104.09-100)×2=51.82(分)。
投标人C：3358/3352×100%=100.18%，总报价得分=60-(100.18-100)×2=59.64(分)。
投标人D：3209/3352×100%=95.73%，总报价得分=60-(100-95.73)×1=55.73(分)。 [解析] 本案例第1问主要考查招投标有关规定。《招标投标法》第三十三条规定，投标人不得以低于成本的报价竞标，也不得以他人名义投标或者以其他方式弄虚作假，骗取中标。所以招标文件中(2)的规定是不妥的。施工合同履行期间，国家颁布的法律、法规、规章和有关政策在合同工程基准日之后发生变化，且因执行相应的法律、法规、规章和政策引起工程造价发生增减变化的，合同双方当事人应当依据法律、法规、规章和有关政策的规定调整合同价款。所以招标文件中(4)的规定是不妥的。缺陷责任期是指施工承包单位对已交付使用的工程承担合同约定的缺陷修复责任的期限。缺陷责任期一般为6个月、12个月或24个月，具体可由发承包双方在合同中约定。缺陷责任期最长不超过2年。所以招标文件中(5)的规定是不妥的。
本案例第2问主要考查投标文件的撤回和投标保证金的退还。投标人撤回已提交的投标文件，应当在投标截止时间前书面通知招标人。招标人已收取投标保证金的，应当自收到投标人书面撤回通知之日起5日内退还。
本案例第3问主要考查投标报价应遵循的原则和投标报价有算术错误的修正。投标报价应遵循的原则：(1)暂列金额应按照招标人提供的其他项目清单中列出的金额填写，不得变动。(2)暂估价不得变动和更改。暂估价中的材料、工程设备暂估价必须按照招标人提供的暂估单价计入清单项目的综合单价；专业工程暂估价必须按照招标人提供的其他项目清单中列出的金额填写。投标报价有算术错误的，评标委员会按以下原则对投标报价进行修正，修正的价格经投标人书面确认后具有约束力，投标人不接受修正价格的，其投标被否决：(1)投标文件中的大写金额与小写金额不一致的，以大写金额为准；(2)总价金额与依据单价计算出的结果不一致的，以单价金额为准修正总价，但单价金额小数点有明显错误的除外。
本案例第4问主要考查投标报价的评审。根据评分标准，首先，计算评标基准价，根据有效投标报价的平均数计算。由于投标人B，E的投标应当被否决，故计算评标基准价时，不将其报价列在内。其次，将投标报价与评标基准价作比较，计算投标报价的最终得分。