综合督查应按下列程序进行：①省级交通运输主管部门汇报本地区工程质量与安全监管工作情况；②质监机构汇报督查项目的质量监督情况，安全监管部门汇报督查项目的安全监管情况；③项目法人(建设单位)汇报项目质量和安全生产的管理情况；④确定抽查合同段；⑤分组查阅资料、查看工地现场、抽检工程实体质量；⑥督查组评议，并对项目进行质量、安全评价；⑦督查组反馈意见。