注册会计师应当获取以下关于控制运行是否有效的审计证据：①控制在所审计期间的相关时点是如何运行的；②控制是否得到一贯执行；③控制由谁或以何种方式执行；选项A中，了解控制是否存在，即被审计单位是否设计了相关控制，属于了解内部控制的范畴。